DNA tests met DIY Bio Groningen

Author
Pieter van Boheemen

In juni dit jaar kwamen uit alle windstreken van Europa DIY biologen naar Amsterdam voor de opening van het Open Wetlab. Een aantal leden van Hacker Space Groningen zagen meteen de nieuwe mogelijkheden van een publiekslaboratorium voor zich. Eenmaal terug in het eigen FabLab ging daarom vrijwel meteen een groep aan de slag om dit te realiseren. Tijdens de Mini Maker Faire toonden zij trots het tot dusver geboekte succes.

Zoals iedere biotechnoloog weet, is één van de meest fundamentele gereedschappen in een biolab de PCR machine. Dit apparaat is in staat een biochemische reactie te begeleiden waarmee DNA kan worden geanalyseerd. Forensische wetenschappers kunnen zo bijvoorbeeld een DNA monster van een verdachte koppelen aan die van een plaatsdelict.

Een aantal jaar geleden hebben makers vanuit de hele wereld samen aan een open source PCR machine gewerkt, de OpenPCR. In het Open Wetlab wordt deze machine al regelmatig gebruikt. Alessio Marcozzi, Richel Bilderbeek en andere leden van DIY Bio Groningen zagen er een uitdaging in om dit ontwerp te verbeteren. Een paar weken geleden stuurde ze een uitnodiging voor een krachtmeting tussen de OpenPCR en de nieuwe machine. Met de OpenPCR in mijn rugzak ben ik daarom afgereisd naar de Mini Maker Faire Groningen.

In NNT Theater de Machinefabriek hing de vertrouwde 'makers' atmosfeer. Tussen tafels met nieuwe 3D-printers en MaKey-MaKeys was er ook een plek gereserveerd voor DIYBio Groningen. Hier konden bezoekers hun DNA isoleren en laten testen. 

Even leek het experiment in het water te vallen. Geen van ons had een Windows of Mac computer bij zich, wat nodig is voor de OpenPCR software. Gelukkig heeft de Ierse biohacker Cathal Garvey laatst de OpenPyCR software op GitHub gezet. Met een aantal kleine aanpassingen kregen we de OpenPCR onder Debian Linux aan de praat. 

Een enkele bezoeker zag de gratis DNA analyse niet zo zitten. “Wat gaan jullie daarna met mijn DNA doen dan?” Ondanks dat we plechtig beloofden het na de analyse gewoon weg te gooien, was zij niet overtuigd. 

Voor sommigen is DIY Bio alleen te vertrouwen als ze het echt zélf mogen doen.

Over de auteur

  • Pieter is a hacker, artist, engineer, researcher and teacher driving forward Free & Open Source Technologies as a catalyzer for social innovati