DNA fingerprinting

Author
Pieter van Boheemen

Ook in de biotechnologie bestaan er 'hello world'-experimenten, die simpelweg demonstreren dat een programma werkt zoals het bedoeld is. In de genetica is het zichtbaar maken en karakteriseren van DNA er zo eentje, dit wordt ook wel in CSI-termen 'DNA fingerprinting' genoemd. Op deze foto zie je zo'n fingerprint:

DNA Fingerprint lambda virus

DNA fingerprinting is nu ook mogelijk in ons Open Wetlab. Met deze techniek kun je bijvoorbeeld op basis van DNA-sporen misdadigers opsporen, ziekteverwerkers detecteren, embryo's selecteren, lichamen identificeren, genetische ziekten voorspellen, verwantschappen/afkomst (zoals vaderschap) vaststellen, paardenvlees in je eten checken, je ideale biologische partner vinden (DNA dating!), etc.

Nu deze techniek gemeengoed begint te worden, zullen de implicaties rondom privacy en identiteitsvraagstukken ook steeds prangender worden. Gelukkig valt ook deze techniek te hacken, en daar zal ik op OHM meer van laten zien. Het is nog niet echt plug & play, maar het is me gelukt om de eerste fingerprint van het bacteriële Lambda-virus te maken. De echte fijnproever ziet dat natuurlijk direct aan het patroon van 2027, 2322, 4361, 6557, 9416 en 23130 basenparen, als ik er bij vertel dat ik HindIII restriction enzymes heb gebruikt :).

Bovendien heb ik hierbij alleen maar Open Hardware gebruikt. De gelbox heb ik speciaal voor dit experiment gemaakt. In deze pdf vind je verder nog een korte visuele beschrijving van wat ik gedaan heb.

Over de auteur

  • Pieter is a hacker, artist, engineer, researcher and teacher driving forward Free & Open Source Technologies as a catalyzer for social innovati